Katedra fytológie sa orientuje na vedné disciplíny širšieho biologického základu.

V rámci výskumu venuje pozornosť lesníckej botanike, fyziológii lesných drevín, fytocenológii a lesníckej typológii, dynamike vegetácie, ekológii lesa, populačnej a evolučnej genetike lesných drevín, embryológii a rozmnožovaniu lesných drevín, šľachteniu lesných drevín a biotechnológiám. V poslednom období sa pracovníci katedry v rámci výskumnej činnosti venujú aj populačnej, evolučnej a konzervačnej genetike poľovnej zveri a voľne žijúcich živočíchov.